分享一篇发表在Nature Chemical Biology上的文章，文章的题目为“A multiplex single-cell RNA-Seq pharmacotranscriptomics pipeline for drug discovery”，通讯作者为来自芬兰奥卢大学的Daniela Ungureanu教授，研究方向是在正常和异常细胞生长（如癌症）过程中由受体酪氨酸激酶控制的信号通路。
高级别浆液性卵巢癌（HGSOC）是最常见的卵巢癌类型，但患者对治疗的反应存在异质性，导致治疗困难。而现有的药物筛选方法难以捕捉这种异质性，限制了个性化治疗的发展。因此作者开发了一种使用抗体-寡核苷酸偶联物进行活细胞的条形码编码，由此进行高通量药物转录组分析的流程，探究了45种药物（涵盖 13 种作用机制）对不同 HGSOC 模型的作用机制。使用这种工作流程能够以单细胞分辨率对患者来源的肿瘤样本进行个性化检测。作者发现不同 HGSOC 模型对药物的反应存在差异，其中PI3K-AKT-mTOR 抑制剂引发了一种耐药性反馈机制，导致受体酪氨酸激酶 (RTK)（如 EGFR）的激活。而对于具有CAV1和EGFR 表达的HGSOC，PI3K-AKT-mTOR 和 EGFR 抑制剂的协同作用能够提高对 HGSOC 细胞的杀伤力，减轻耐药反馈。总之，该研究开发了一种基于转录组测序的流程，可以有效地研究药物对肿瘤细胞的影响，并发现新的治疗靶点和策略。该研究为 HGSOC 的个性化治疗提供了新的思路，该研究开发的单细胞药物转录组测序流程可以应用于其他癌症的治疗研究。原文链接：
https://www.nature.com/articles/s41589-024-01761-8
文章引用：10.1038/s41589-024-01761-8
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